Если честно, довольно странно читать в данной статье о необходимости применения каких-то костылей для Ajax пагинации в custom и тем более о невозможности сделать это в виде полноценного решения, как Вы пишете например, в этой статье - https://sandev.pro/web/50-ajax-navigaciya-v-tege-custom.html . На самом деле можно решить эту задачу намного проще, чем вы здесь описали, модуль правда платный - https://new-dev.ru/10-ajax-navigaciya-v-custom.html . В файл движка достаточно внести одну строчку, если же версии 13 и выше - там вообще используется система плагинов. Используется оформление "стандартной" пагинации DLE, не надо колдовать со стилями и т.п. Никаких недостатков не было замечено.